中科院文献情报系统—海洋科技情报网 Chinese Academy of Sciences | marine science and technology information network system

微信公众号

您当前的位置: 首页 > 科研动态

科研动态共计 539 条信息

      全选  导出

1 被动大陆边缘深水水道汇聚区域对物源供给变化的响应研究新进展 2019-08-08

近日,深海所深海地球物理与资源研究室吴时国团队报道了巴西东南部大陆边缘Espírito Santo盆地深水水道的研究进展。作为连接大陆和深水盆地的重要沉积物通道,深水水道在全球的陆架边缘广泛发育。它是深水沉积系统的重要组成部分,也是油气储藏的重要场所。研究人员利用三维地震数据,发现深水水道的汇聚区域记录了水道支流的物源变化信息。研究人员认为陆源碎屑物质的注入影响了水道的活跃程度,进而控制了水道汇聚区域的演化过程。水道支流提供的碎屑物质会影响水道的侧向迁移,进而导致水道支流的汇聚点位置、水道路径、水道形态以及水道内部沉积特征的变化。侧向迁移是水道调节外部物源供给变化的重要途经,当物源供给增大时,大量碎屑物质的输入会增大汇聚区域水道侧向迁移的频率,导致水道支流汇聚点以及水道的路径发生迁移,水道的弯曲度以及宽度增大,水道存储的沉积物相对其它区域也会明显增多。  此项研究近期在线发表于国际地质学期刊《Geological Society of America Bulletin》(Y.Qin*,T.Alves,J.Constantine,D.Gamboa,S.Wu,Effect of channel tributaries on the evolution of submarine channel confluences(Espírito Santo Basin,SE Brazil)),由中科院深海所、英国卡迪夫大学,美国威廉姆斯学院和英国地质调查局科研人员共同完成,深海所博士后秦永鹏为本文第一作者。 查看详细>>

来源:中科院深海科学与工程研究所 点击量:113

2 海洋试点国家实验室在Nature Communications发表细菌血清抗性控制的最新研究成果 2019-08-08

补体是宿主非特异性免疫的重要组成部分,在清除入侵病原菌中起到关键作用。然而,许多病原菌可抵抗补体的杀菌作用,称为血清抗性,为一种极其重要的病原性。血清抗性菌往往具有耐药性,故可同时逃避宿主血清补体和抗生素的双重杀菌作用,引起难以控制的感染。虽然血清抗性发现已有100余年的历史,但如何有效控制血清抗性病原菌尚不知道。 海洋试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室彭博教授课题组与中山大学彭宣宪和李惠课题组合作,开展血清抗性细菌代谢组学及其重编的研究,相关研究结果新近发表于Nature Communications。 基于前期在逆转细菌耐药性的研究中所创建的重编代谢组学理论和应用(Cell Metabolism,2015,21,249–261;Proc Natl Acad Sci USA,2018,115,E1578-E1587),课题组发现血清抗性菌最重要的代谢特征为甘氨酸-丝氨酸-苏氨酸代谢通路显著下调,采用外源甘氨酸、丝氨酸或苏氨酸重编细菌代谢组,可以大大提高对血清补体的敏感性,同时也可以提高对抗生素的敏感性。其主要机制为外源甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸促进三羧酸循环中α-酮戊二酸的积累,以抑制ATP合酶;同时高浓度甘氨酸抑制嘌呤通路合成ATP;使ATP合成的两条主要途径同时受到抑制,导致ATP生成下降;进而下调cAMP/CRP复合物,上调细菌外膜补体结合蛋白HtrE,NfrA和YhcD表达。高浓度的甘氨酸还可以增加质子动力势,促进血清补体与补体结合蛋白的结合,逆转血清抗性,实现血清补体高效杀菌(图1)。甘氨酸促进补体杀菌在人血清、小鼠血清、猪血清、鱼血浆和对虾血浆均获得相似结果,在BALB/c小鼠和Rag1-/-(无T-和B-细胞免疫)细胞缺陷小鼠体内也得到证实。该研究以模式大肠杆菌BW25113 K12为对象进行相关机制研究,对水产养殖重要病原菌弧菌、畜禽病原菌性大肠杆菌和人类病原菌大肠杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯菌和超级耐药菌耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)均具有相似效果。这些发现为控制人类和动物养殖病原菌感染提供了新的思路。 该研究不仅对解决百年难题取得突破性进展,而且在机制上有2个新发现:1)发现一条新的能量代谢调节通路:甘氨酸依次转化为α-酮戊二酸后,与ATP合酶结合,抑制该酶活性,证明代谢物反馈调节是稳定ATP和膜电位的重要机制。2)发现代谢物可以优于基因调控来主导物质代谢流向:甘氨酸通过GlyA和Kbl转化进入三羧酸循环和通过PurR转化进入嘌呤代谢;尽管此前研究表明purR负调控glyA,但高浓度的甘氨酸可以促进GlyA和Kbl的表达,使甘氨酸代谢流进入中心碳代谢而不进入嘌呤代谢。此外,PurR调节kbl以及glyA调节crp/CRP以及HtrE,NfrA,和YhcD是补体结合蛋白均未曾报道。 这一研究主要在蓝色粮仓科技创新重点专项(2018YFD0900501/4),基金委(U1701235,31822058,31770045,41276145)和“蓝色生命”重大成果培育支持计划的资助下完成。上述研究结果新近发表于Nat Commun2019;10:3325 https://doi.org/10.1038/s41467-019-11129-5。 查看详细>>

来源:青岛海洋科学与技术试点国家实验室 点击量:105

3 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室完成国际首个蚶科基因组参考图谱 2019-08-08

日前,在国家重点研发计划和贝类产业技术体系等项目支持下,海洋试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室王崇明研究员团队、黄海水产研究所杨爱国研究员团队与德国阿尔弗雷德·韦格纳研究所赫尔姆霍兹极地和海洋研究中心翁贝托·罗萨尼(Umberto Rosani)博士等合作,成功破译魁蚶基因组,研究成果于7月9日正式发表在《大数据科学》(GigaScience)杂志。该研究利用第二、三代测序和Hi-C染色体构象捕获技术,构建了国际上首个染色体水平的蚶科动物基因组参考图谱。研究揭示,魁蚶基因组大小为885 Mb,Scaffold N50达到45 Mb,利用Hi-C技术成功将99.35%的组装序列挂载到染色体上,经进一步分析发现魁蚶基因组中重复序列高达408 Mb,占基因组总长的46%。 魁蚶俗称赤贝、血贝、大毛蛤,是一种大型海洋底栖经济贝类,广泛分布于太平洋西北部的日本海、黄海、渤海及东海沿岸,成贝个大体肥,肉质鲜美,经济价值较高。近年来,我国魁蚶苗种生产和增养殖规模不断扩大,经济和社会效益显著,然而其种质质量下降、病害高发等问题日趋严重。魁蚶及蚶科贝类基因组信息的匮乏成为我们理解其抗病、抗逆机制的障碍,破译魁蚶基因组信息、开展重要性状遗传改良成为当下的重要课题。该项研究成果为蚶科贝类抗病抗逆、生长发育等重要性状的遗传解析以及种质改良等相关研究提供了重要理论支撑。 海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室白昌明博士、辛鲁生博士为该论文的共同第一作者,王崇明研究员为该论文的通讯作者。 全文链接:Chromosomal-level assembly of the blood clam,Scapharca(Anadara)broughtonii,using long sequence reads and Hi-C https://academic.oup.com/gigascience/article/8/7/giz067/5530322 大数据科学(GigaScience)关注生命科学和生物医学领域全方位的“大数据”研究,是一个创新的开放获取、开放数据、开放同行评议的学术期刊,在基因组、大数据领域具有较高的影响力。 查看详细>>

来源:青岛海洋科学与技术试点国家实验室 点击量:90

4 研究发现近海水产养殖对环境影响较小 2019-08-06

迈阿密大学海洋与大气科学学院的科学家们进行的一项研究发现,巴拿马海岸附近的一个大型商业化养鱼场对周围水域的环境影响很小。研究人员在沉水养鱼池的一个上游和三个下游位置收集了水样,以调查近海养鱼场是否会造成重大或累积的影响。同时还收集了沉积物样本,以评估水产养殖设施对海底的影响。 调查数据显示,鱼场只释放了少量的营养物质,并表明,如果选址得当,商业化的近海水产养殖设施有可能产生相对较小的污染足迹。研究结果还表明,与人类消费的其他所有形式的动物蛋白生产过程相比,海洋鱼类养殖的任何影响都是最小的。 第一作者Aaron Welch博士认为这项研究是一个非常重要的里程碑,有助于美国发展近海水产养殖。该研究的合著者Daniel Benetti教授认为所有关注美国和其他国家近海水产养殖扩张的利益攸关方都会对这项研究感兴趣。这是第一份介绍利用海洋潜水笼技术的商业规模水产养殖设施的研究。 这项研究主要为了评估近海养鱼场造成的有机和无机污染的影响,这是与商业水产养殖生产有关的主要问题之一。这项研究表明,与其他生产方法相比,人类食用的海产品可以在海洋环境中生产,对环境的影响相对较小。 该研究成果已发表在《世界水产养殖学会》(World Aquaculture Society)杂志上,论文标题为《热带加勒比的海底网箱水产养殖设施的营养足迹》(The nutrient footprint of asubmerged-cage offshore aquaculture facility located in the tropical Caribbean),该研究受NOAA海洋渔业倡议(NA12NMF4330087)和NOAA海洋水产养殖研究项目(NA10OAR4170079)的资助。 (张灿影编译) 查看详细>>

来源:美国迈阿密大学 点击量:397

版权所有@2017中国科学院文献情报中心

制作维护:中国科学院文献情报中心信息系统部地址:北京中关村北四环西路33号邮政编号:100190